宝藤医学PPmeta案例追踪三mNGS检

近期,宝藤生物通过感染宏基因组检测(PPmetaTM)从一位6岁女童肺泡灌洗液中检测到肺炎支原体(感染宏基因组检测到条序列)。

感染宏基因组检出结果

肺炎支原体

病原学

支原体缺乏细胞壁,仅由细胞膜包绕,因此β-内酰胺类抗生素(青霉素类和头孢菌素类)对支原体不起作用。目前至少从人类分离出13种支原体、2种无胆甾原体和2种脲原体。大部分上述微生物被认为是口腔和泌尿生殖道黏膜内的正常菌群。只有肺炎支原体、人型支原体、解脲脲原体和微小脲原体这4种对免疫功能正常的人具有致病性。肺炎支原体主要感染呼吸道,而人型支原体、解脲脲原体和微小脲原体与一系列泌尿生殖道异常和新生儿感染有关。

流行病学

世界各地都存在肺炎支原体感染。肺炎支原体上呼吸道疾病的发生率可能是肺炎支原体肺炎的20倍。感染通过患者咳嗽时喷出的飞沫实现人际传播,约80%会出现明显的临床表现。肺炎支原体的潜伏期是2-4周,因此特定人群的感染事件可能长达数周。儿童的家族内感染率是84%,而成人是41%。肺炎支原体疾病通常在军事基地、寄宿制学校和夏令营等处暴发。感染往往呈地方性,每4-7年发生一次散发流行,没有季节性。

肺炎支原体是儿童和成人社区获得性呼吸系统疾病的主要原因,通常与肺炎衣原体和军团菌一起被认为是“非典型”社区获得性肺炎最重要的细菌性病原体。肺炎支原体是成人社区获得性肺炎最重要的“非典型”病原体。

临床表现

肺炎支原体会引起上呼吸道感染、肺炎以及肺外表现。

上呼吸道感染和肺炎

急性肺炎支原体感染通常表现为咽炎、气管支气管炎、反应性气道疾病或非特异性上呼吸道综合征。

肺炎发生于3%-13%的感染者,发病通常缓慢(数日内),也可能更为突然。支原体肺炎可能开始于咽喉疼痛,最常见的前驱症状是咳嗽,多为干咳,但部分患者也会咳痰。大多数患者表现为头痛、萎靡、寒战和发热。

肺外表现

皮肤系统表现:肺炎支原体感染引起的皮疹包括红斑(斑疹或斑丘疹)、水疱、大疱、瘀点和荨麻疹,约17%的肺炎支原体肺炎患者存在皮疹。重症多形红斑(Stevens-Johnson综合征)是临床上与肺炎支原体感染相关的最严重的皮疹。

神经系统表现:最常见的是脑膜脑炎、脑炎、吉兰-巴雷综合征和无菌性脑膜炎。

血液系统表现:溶血性贫血、再生障碍性贫血、冷凝集素、弥散性血管内凝血和高凝血病。

心血管系统表现:心肌炎、心包炎,甚至心功能衰竭。

治疗策略

虽然大多数未治疗患者的症状可在2-3周内消失且无明显的相关发病,但肺炎支原体肺炎可以是一种严重的疾病,需要使用适当的抗菌药物进行治疗才能缓解。如大环内酯类(阿奇霉素、克拉霉素和红霉素)、四环素类(多西环素)以及喹诺酮类(左氧氟沙星、莫西沙星、吉美沙星(非环丙沙星或氧氟沙星))。

如果某地区大环内酯类药物耐药情况突出,或怀疑出现大环内酯类耐药,则应考虑使用非大环内酯类抗生素进行治疗,此外在这种情况下进行肺炎支原体培养对制定治疗方案有帮助,培养能为药敏试验提供菌株。

宝藤PPmetaTM-感染宏基因组检测

谱析源TM

检测内容:直接对样本中的DNA进行高通量测序,鉴定样本中可能存在的病原菌,辅助临床决策。覆盖细菌、真菌、DNA病毒、寄生虫、衣原体、立克次氏体、螺旋体等种微生物。

报告周期:收到样本后29-72h

宏析源TM

检测内容:直接对样本中的DNARNA进行高通量测序,鉴定样本中可能存在的病原菌,辅助临床决策。覆盖细菌、真菌、病毒、寄生虫、衣原体、立克次氏体、螺旋体等种微生物。

报告周期:收到样本后29-72h

参考文献及书籍

赵顺英.肺炎支原体感染的临床表现和肺外并发症[J].实用儿科临床杂志,(04):16-17.

《哈里森感染》第84章支原体感染

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宝藤医学PPmeta案例追踪一:mNGS检出婴儿利什曼原虫感染

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